กระทรวงศึกษาธิการได้ประกาศจัดตั้งศูนย์บริการการศึกษานอกโรงเรียนอำเภอวิเศษชัยชาญ เมื่อวันที่ 25 สิงหาคม พ.ศ. 2536 สังกัดศูนย์การศึกษานอกโรงเรียนจังหวัดอ่างทอง กรมการศึกษานอกโรงเรียน กระทรวงศึกษาธิการ โดยใช้อาคารเรียนหลังเก่าของโรงเรียนวิเศษชัยชาญ "ตันติวิทยาภูมิ" อท 4 (2482) ซึ่งเป็นอาคารไม้สองชั้น เป็นสำนักงาน สถานที่พบกลุ่มนักศึกษาและห้องเรียนวิชาชีพระยะสั้น

เมื่อวันที่ 4 มีนาคม พ.ศ. 2551 พระราชบัญญัติส่งเสริมการศึกษานอกระบบและการศึกษาตามอัธยาศัย พ.ศ. 2551 มีผลบังคับใช้กระทรวงศึกษาธิการได้มีประกาศลงวันที่ 10 มีนาคม พ.ศ. 2551 ประกาศรายชื่อสถานศึกษาที่มีความพร้อมปฏิบัติภาระกิจสถานศึกษาตามพระราชบัญญัติดังกล่าว เป็นผลให้ศูนย์บริการการศึกษานอกโรงเรียนอำเภอวิเศษชัยชาญเปลี่ยนชื่อสถานศึกษาใหม่เป็นชื่อ ศูนย์การศึกษานอกระบบและการศึกษาตามอัธยาศัยอำเภอวิเศษชัยชาญ สังกัดสำนักงานส่งเสริมการศึกษานอกระบบและการศึกษาตามอัธยาศัยจังหวัดอ่างทอง